Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps11P62281 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps11P62281 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps11P62281 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms