Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smg6P61406 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smg6P61406 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smg6P61406 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Smg6P61406 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Smg6P61406 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smg6P61406 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg6P61406 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms