Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kdm2aP59997 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm2aP59997 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms