Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CgnP59242 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CgnP59242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CgnP59242 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CgnP59242 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CgnP59242 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CgnP59242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CgnP59242 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CgnP59242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CgnP59242 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CgnP59242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CgnP59242 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CgnP59242 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CgnP59242 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CgnP59242 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CgnP59242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CgnP59242 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CgnP59242 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CgnP59242 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CgnP59242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CgnP59242 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms