Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PltpP55065 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PltpP55065 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PltpP55065 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PltpP55065 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PltpP55065 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PltpP55065 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PltpP55065 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PltpP55065 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PltpP55065 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PltpP55065 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PltpP55065 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PltpP55065 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PltpP55065 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PltpP55065 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PltpP55065 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PltpP55065 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms