Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms