Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa11P50709 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa11P50709 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa11P50709 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.3 ms