Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh1P48985 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms