Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GastP48757 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GastP48757 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GastP48757 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GastP48757 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GastP48757 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GastP48757 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GastP48757 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GastP48757 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GastP48757 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GastP48757 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GastP48757 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GastP48757 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GastP48757 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GastP48757 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GastP48757 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GastP48757 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GastP48757 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GastP48757 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GastP48757 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GastP48757 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GastP48757 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms