Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4P46935 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms