Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TfamP40630 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TfamP40630 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TfamP40630 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TfamP40630 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TfamP40630 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TfamP40630 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TfamP40630 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TfamP40630 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TfamP40630 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TfamP40630 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TfamP40630 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TfamP40630 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TfamP40630 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TfamP40630 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TfamP40630 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TfamP40630 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TfamP40630 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TfamP40630 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TfamP40630 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TfamP40630 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TfamP40630 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms