Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl12P35979 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl12P35979 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms