Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab20P35295 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab20P35295 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab20P35295 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab20P35295 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms