Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms