Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd1P30999 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms