Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp1P29452 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp1P29452 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Casp1P29452 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms