Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kif3aP28741 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms