Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb9P28076 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms