Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PparaP23204 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PparaP23204 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PparaP23204 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PparaP23204 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PparaP23204 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PparaP23204 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PparaP23204 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PparaP23204 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PparaP23204 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PparaP23204 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PparaP23204 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PparaP23204 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PparaP23204 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PparaP23204 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PparaP23204 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PparaP23204 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PparaP23204 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PparaP23204 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PparaP23204 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PparaP23204 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PparaP23204 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PparaP23204 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PparaP23204 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PparaP23204 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PparaP23204 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PparaP23204 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PparaP23204 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PparaP23204 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PparaP23204 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PparaP23204 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PparaP23204 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PparaP23204 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PparaP23204 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PparaP23204 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PparaP23204 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PparaP23204 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms