Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox4i1P19783 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cox4i1P19783 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox4i1P19783 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms