Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18528 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18528 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18528 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18528 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18528 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18528 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18528 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18528 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18528 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18528 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18528 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18528 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18528 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18528 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18528 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18528 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18528 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18528 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18528 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18528 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18528 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18528 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18528 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18528 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18528 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms