Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LdhbP16125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhbP16125 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhbP16125 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LdhbP16125 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LdhbP16125 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhbP16125 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LdhbP16125 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms