Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd5P13379 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms