Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms