Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR5

Tdpoz1, TD and POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz1P0DMR5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdpoz1P0DMR5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdpoz1P0DMR5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms