Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb3P09026 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb3P09026 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms