Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2aP08775 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2aP08775 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms