Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Prm2P07978 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms