Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf3P05524 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms