Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01679 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01679 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01679 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01679 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01679 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01679 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01679 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01679 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01679 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
P01679 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01679 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01679 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01679 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01679 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01679 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01679 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01679 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01679 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01679 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01679 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01679 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01679 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01679 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01679 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01679 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01679 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
P01679 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01679 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01679 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01679 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01679 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01679 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
P01679 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01679 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01679 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01679 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
P01679 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01679 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01679 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01679 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms