Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc4a4O88343 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a4O88343 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms