Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mmp8O70138 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp8O70138 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp8O70138 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms