Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cer1O55233 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cer1O55233 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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