Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpd52l1O54818 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpd52l1O54818 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms