Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac1O09106 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac1O09106 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms