Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa8J3QNX5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa8J3QNX5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa8J3QNX5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa8J3QNX5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa8J3QNX5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa8J3QNX5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa8J3QNX5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa8J3QNX5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms