Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930544D05RikJ3QK56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms