Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem200cJ3QK46 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200cJ3QK46 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms