Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Obox6G3X9U1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Obox6G3X9U1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Obox6G3X9U1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms