Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r167G3UW71 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms