Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms