Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5624F6ZZG8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5624F6ZZG8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms