Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21977F6U3N7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms