Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms