Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms