Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn2r35E9Q7U8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r35E9Q7U8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r35E9Q7U8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms