Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20425E9Q035 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms