Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc144bE9PVZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms