Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r49D3Z6L3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r49D3Z6L3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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