Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hfm1D3Z4R1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hfm1D3Z4R1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hfm1D3Z4R1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms