Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms